《中国大学评价》课题组提出的2007中国一流大学的标准是:“在中国大学评价中,获得工学前6名、理学、医学、管理学、文学前3名、农学、经济学、法学前2名、历史学、教育学、哲学第1名的研究型大学;或者是研究1型大学” 。此标准与上一年度相比,增加了研究1型大学为中国一流大学。
按照以上标准,2007年中国有16所大学入选中国一流大学,其中中山大学、南开大学以研究1型首次进入中国一流大学。各学科门类的变化是:复旦大学的医学从第三名上升到第二名,上海交通大学的医学从第四名上升到第三名。
在11个学科门类中,北京大学获得理学、医学、文学、法学、哲学五个第一名。北京大学的经济学、历史学也具备获得第一名的师资力量。